Prosim o radu. Může komisař kontrolovat autoškolu a na základě jakého zákonného ustanovení?

Oprávnění ke kontrole je dáno Kontrolním řádem: https://www.zakonyprolidi.cz/cs/2012-255
a plyne ze zákona č. 247/2000 Sb., § 54 odst. 1 první věta.
https://www.zakonyprolidi.cz/cs/2000-247#p54

Nikdo, ani zkušební komisař to nemůže činit o své vůli, musí k tomu být pověřen:

PRŮBĚH KONTROLY
§ 4
Pověření ke kontrole
(1) Kontrolu vykonává fyzická osoba, kterou kontrolní orgán k tomu pověřil (dále jen „kontrolující“).
(2) Pověření ke kontrole vydává vedoucí kontrolního orgánu, anebo osoba k tomu pověřená vedoucím kontrolního orgánu (dále jen „nadřízená osoba kontrolujícího“). Je-li při jednotlivé kontrole kontrolujících více, určí nadřízená osoba kontrolujícího jednoho z nich vedoucím kontrolní skupiny.
(3) Pověření ke kontrole má formu
a) písemného pověření k jednotlivé kontrole, nebo
b) průkazu, stanoví-li tak jiný právní předpis.